Bên cạnh đó, Bộ NN&PTNT cũng được giao thực hiện 30 nhiệm vụ chuyên ngành của mình.
Nghị định cũng quy đinh cơ cấu tổ chức đối với Bộ NN&PTNT gồm 27 đơn vị đầu mối, trong đó đáng chú ý là có một số đơn vị mới được thành lập là: Cục Chế biến, Thương mại nông lâm thuỷ sản và nghề muối; Cục Nuôi trồng thuỷ sản; Cục Kinh tế hợp tác và PTNT; Cục Quản lý chất lượng nông lâm sản và thuỷ sản; Vụ Khoa học, Công nghệ và Môi trường; Trung tâm Khuyến nông - khuyến ngư quốc gia