Theo Điều 4 QĐ số 305 ngày 01/03/2025 của Bộ Nông nghiệp và Môi trường, quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức, Viện Chiến lược, Chính sách Nông nghiệp và Môi trường gồm 15 đơn vị trực thuộc như sau:

I. Các đơn vị hành chính – chuyên môn

1. Văn phòng

2. Phòng Kế hoạch – Tài chính

3. Phòng Khoa học và Hợp tác quốc tế

4. Ban Thể chế nông thôn

5. Ban Tổng hợp và Dự báo chiến lược

6. Ban Kinh tế tài nguyên và môi trường

7. Ban Thị trường và Ngành hàng

8. Ban Môi trường và Phát triển bền vững

9. Ban Biến đổi khí hậu

10. Ban Tài nguyên thiên nhiên

II. Các đơn vị sự nghiệp công lập trực thuộc

11. Trung tâm Thông tin và Dịch vụ nông nghiệp và môi trường

12. Trung tâm Phát triển và Ứng dụng khoa học công nghệ về đất đai

13. Trung tâm Phát triển nông thôn

14. Trung tâm Tư vấn chính sách nông nghiệp

15. Tạp chí Môi trường

📌 Ghi chú: Các đơn vị từ khoản 11 đến khoản 15 có con dấu và được mở tài khoản riêng để hoạt động theo quy định của pháp luật.

⚙️ Tổ chức nhân sự và điều hành

• Mỗi đơn vị có người đứng đầu (Trưởng phòng, Trưởng ban, Giám đốc trung tâm) và các cấp phó (Phó trưởng phòng, Phó giám đốc...).

• Viện trưởng là người quyết định việc bổ nhiệm, miễn nhiệm lãnh đạo các đơn vị trực thuộc theo đúng quy định pháp luật hiện hành.

• Viện trưởng đồng thời chịu trách nhiệm tổ chức sắp xếp nhân sự theo vị trí việc làm, quy định chức năng – nhiệm vụ cho từng đơn vị, và trình Bộ phê duyệt Điều lệ tổ chức và hoạt động của Viện.